A ilha era utilizada para a agricultura com o cultivo de milho, feijão, mandioca, abóbora e arroz. Reflorestada pelo artista plástico e ex-Frei Franciscano Antônio Augusto Sobrinho, conhecido como Frei Pacífico, o local conta com cerca de cinco mil árvores nativas e com uma diversidade de árvores frutíferas, lá você pode encontrar espécies de outras regiões, como o cacau por exemplo. Reza a lenda que quem abraça a enorme seringueira que existe na ilha acaba se casando.

Quem visita a ilha é convidado a plantar uma árvore. Dando continuidade ao trabalho de reflorestamento, iniciado nos anos 80, nesta área, que faz parte do Parque Nacional da Ilha Grande desde 1997. A São Francisco está inserida no plano de manejo, sendo apta a receber turistas, estudantes, pesquisadores e interessados em educação ambiental.

O acesso à ilha é realizado por empresas náuticas que oferecem passeios de barco com visitação, o local dispõe de um galpão para refeições, além de trilha ecológica.